A highly virulent variant of HIV-1 circulating in the Netherlands
Wymant C., Bezemer D., Blanquart F., Ferretti L., Gall A., Hall M., Golubchik T., Bakker M., Ong SH., Zhao L., Bonsall D., de Cesare M., MacIntyre-Cockett G., Abeler-Dörner L., Albert J., Bannert N., Fellay J., Grabowski MK., Gunsenheimer-Bartmeyer B., Günthard HF., Kivelä P., Kouyos RD., Laeyendecker O., Meyer L., Porter K., Ristola M., van Sighem A., Berkhout B., Kellam P., Cornelissen M., Reiss P., Fraser C., Aubert V., Battegay M., Bernasconi E., Böni J., Braun DL., Bucher HC., Burton-Jeangros C., Calmy A., Cavassini M., Dollenmaier G., Egger M., Elzi L., Fehr J., Fellay J., Furrer H., Fux CA., Gorgievski M., Günthard H., Haerry D., Hasse B., Hirsch HH., Hoffmann M., Hösli I., Kahlert C., Kaiser L., Keiser O., Klimkait T., Kouyos R., Kovari H., Ledergerber B., Martinetti G., de Tejada BM., Marzolini C., Metzner K., Müller N., Nadal D., Nicca D., Pantaleo G., Rauch A., Regenass S., Rudin C., Schöni-Affolter F., Schmid P., Speck R., Stöckle M., Tarr P., Trkola A., Vernazza P., Weber R., Yerly S., van der Valk M., Geerlings SE., Goorhuis A., Hovius JW., Lempkes B., Nellen FJB., van der Poll T., Prins JM., Reiss P., van Vugt M., Wiersinga WJ., Wit FWMN., van Duinen M., van Eden J., Hazenberg A., van Hes AMH., Pijnappel FJJ., Smalhout SY., Weijsenfeld AM., Jurriaans S., Back NKT., Zaaijer HL., Berkhout B., Cornelissen MTE., Schinkel CJ., Wolthers KC., Peters EJG., van Agtmael MA., Autar RS., Bomers M., Sigaloff KCE., Heitmuller M., Laan LM., Ang CW., van Houdt R., Jonges M., Kuijpers TW., Pajkrt D., Scherpbier HJ., de Boer C., van der Plas A., van den Berge M., Stegeman A., Baas S., Hage de Looff L., Buiting A., Reuwer A., Veenemans J., Wintermans B., Pronk MJH., Ammerlaan HSM., van den Bersselaar DNJ., de Munnik ES., Deiman B., Jansz AR., Scharnhorst V., Tjhie J., Wegdam MCA., van Eeden A., Nellen J., Brokking W., Elsenburg LJM., Nobel H., van Kasteren MEE., Berrevoets MAH., Brouwer AE., Adams A., van Erve R., de Kruijf-van de Wiel BAFM., Keelan-Phaf S., van de Ven B., van der Ven B., Buiting AGM., Murck JL., de Vries-Sluijs TEMS., Bax HI., van Gorp ECM., de Jong-Peltenburg NC., de Mendonç̧a Melo M., van Nood E., Nouwen JL., Rijnders BJA., Rokx C., Schurink CAM., Slobbe L., Verbon A., Bassant N., van Beek JEA., Vriesde M., van Zonneveld LM., de Groot J., Boucher CAB., Koopmans MPG., van Kampen JJA., Fraaij PLA., van Rossum AMC., Vermont CL., van der Knaap LC., Visser E., Branger J., Douma RA., Cents-Bosma AS., Duijf-van de Ven CJHM., Schippers EF., van Nieuwkoop C., van Ijperen JM., Geilings J., van der Hut G., van Burgel ND., Leyten EMS., Gelinck LBS., Mollema F., Davids-Veldhuis S., Tearno C., Wildenbeest GS., Heikens E., Groeneveld PHP., Bouwhuis JW., Lammers AJJ., Kraan S., van Hulzen AGW., Kruiper MSM., van der Bliek GL., Bor PCJ., Debast SB., Wagenvoort GHJ., Kroon FP., de Boer MGJ., Jolink H., Lambregts MMC., Roukens AHE., Scheper H., Dorama W., van Holten N., Claas ECJ., Wessels E., den Hollander JG., El Moussaoui R., Pogany K., Brouwer CJ., Smit JV., Struik-Kalkman D., van Niekerk T., Pontesilli O., Lowe SH., Oude Lashof AML., Posthouwer D., van Wolfswinkel ME., Ackens RP., Burgers K., Schippers J., Weijenberg-Maes B., van Loo IHM., Havenith TRA., van Vonderen MGA., Kampschreur LM., Faber S., Steeman-Bouma R., Al Moujahid A., Kootstra GJ., Delsing CE., van der Burg-van de Plas M., Scheiberlich L., Kortmann W., van Twillert G., Renckens R., Ruiter-Pronk D., van Truijen-Oud FA., Cohen Stuart JWT., Jansen ER., Hoogewerf M., Rozemeijer W., van der Reijden WA., Sinnige JC., Brinkman K., van den Berk GEL., Blok WL., Lettinga KD., de Regt M., Schouten WEM., Stalenhoef JE., Veenstra J., Vrouenraets SME., Blaauw H., Geerders GF., Kleene MJ., Kok M., Knapen M., van der Meché IB., Mulder-Seeleman E., Toonen AJM., Wijnands S., Wttewaal E., Kwa D., van Crevel R., van Aerde K., Dofferhoff ASM., Henriet SSV., ter Hofstede HJM., Hoogerwerf J., Keuter M., Richel O., Albers M., Grintjes-Huisman KJT., de Haan M., Marneef M., Strik-Albers R., Rahamat-Langendoen J., Stelma FF., Burger D., Gisolf EH., Hassing RJ., Claassen M., ter Beest G., van Bentum PHM., Langebeek N., Tiemessen R., Swanink CMA., van Lelyveld SFL., Soetekouw R., van der Prijt LMM., van der Swaluw J., Bermon N., van der Reijden WA., Jansen R., Herpers BL., Veenendaal D., Verhagen DWM., Lauw FN., van Broekhuizen MC., van Wijk M., Bierman WFW., Bakker M., Kleinnijenhuis J., Kloeze E., Middel A., Postma DF., Schölvinck EH., Stienstra Y., Verhage AR., Wouthuyzen-Bakker M., Boonstra A., de Groot-de Jonge H., van der Meulen PA., de Weerd DA., Niesters HGM., van Leer-Buter CC., Knoester M., Hoepelman AIM., Arends JE., Barth RE., Bruns AHW., Ellerbroek PM., Mudrikova T., Oosterheert JJ., Schadd EM., van Welzen BJ., Aarsman K., Griffioen-van Santen BMG., de Kroon I., van Berkel M., van Rooijen CSAM., Schuurman R., Verduyn-Lunel F., Wensing AMJ., Bont LJ., Geelen SPM., Loeffen YGT., Wolfs TFW., Nauta N., Rooijakkers EOW., Holtsema H., Voigt R., van de Wetering D., Alberto A., van der Meer I., Rosingh A., Halaby T., Zaheri S., Boyd AC., Bezemer DO., van Sighem AI., Smit C., Hillebregt M., de Jong A., Woudstra T., Bergsma D., Meijering R., van de Sande L., Rutkens T., van der Vliet S., de Groot L., van den Akker M., Bakker Y., El Berkaoui A., Bezemer M., Brétin N., Djoechro E., Groters M., Kruijne E., Lelivelt KJ., Lodewijk C., Lucas E., Munjishvili L., Paling F., Peeck B., Ree C., Regtop R., Ruijs Y., Schoorl M., Schnörr P., Scheigrond A., Tuijn E., Veenenberg L., Visser KM., Witte EC., Ruijs Y., Van Frankenhuijsen M., Allegre T., Makhloufi D., Livrozet J-M., Chiarello P., Godinot M., Brunel-Dalmas F., Gibert S., Trepo C., Peyramond D., Miailhes P., Koffi J., Thoirain V., Brochier C., Baudry T., Pailhes S., Lafeuillade A., Philip G., Hittinger G., Assi A., Lambry V., Rosenthal E., Naqvi A., Dunais B., Cua E., Pradier C., Durant J., Joulie A., Quinsat D., Tempesta S., Ravaux I., Martin IP., Faucher O., Cloarec N., Champagne H., Pichancourt G., Morlat P., Pistone T., Bonnet F., Mercie P., Faure I., Hessamfar M., Malvy D., Lacoste D., Pertusa M-C., Vandenhende M-A., Bernard N., Paccalin F., Martell C., Roger-Schmelz J., Receveur M-C., Duffau P., Dondia D., Ribeiro E., Caltado S., Neau D., Dupont M., Dutronc H., Dauchy F., Cazanave C., Vareil M-O., Wirth G., Le Puil S., Pellegrin J-L., Raymond I., Viallard J-F., Chaigne de Lalande S., Garipuy D., Delobel P., Obadia M., Cuzin L., Alvarez M., Biezunski N., Porte L., Massip P., Debard A., Balsarin F., Lagarrigue M., Prevoteau du Clary F., Aquilina C., Reynes J., Baillat V., Merle C., Lemoing V., Atoui N., Makinson A., Jacquet JM., Psomas C., Tramoni C., Aumaitre H., Saada M., Medus M., Malet M., Eden A., Neuville S., Ferreyra M., Sotto A., Barbuat C., Rouanet I., Leureillard D., Mauboussin J-M., Lechiche C., Donsesco R., Cabie A., Abel S., Pierre-Francois S., Batala A-S., Cerland C., Rangom C., Theresine N., Hoen B., Lamaury I., Fabre I., Schepers K., Curlier E., Ouissa R., Gaud C., Ricaud C., Rodet R., Wartel G., Sautron C., Beck-Wirth G., Michel C., Beck C., Halna J-M., Kowalczyk J., Benomar M., Drobacheff-Thiebaut C., Chirouze C., Faucher J-F., Parcelier F., Foltzer A., Haffner-Mauvais C., Hustache Mathieu M., Proust A., Piroth L., Chavanet P., Duong M., Buisson M., Waldner A., Mahy S., Gohier S., Croisier D., May T., Delestan M., Andre M., Zadeh MM., Martinot M., Rosolen B., Pachart A., Martha B., Jeunet N., Rey D., Cheneau C., Partisani M., Priester M., Bernard-Henry C., Batard M-L., Fischer P., Berger J-L., Kmiec I., Robineau O., Huleux T., Ajana F., Alcaraz I., Allienne C., Baclet V., Meybeck A., Valette M., Viget N., Aissi E., Biekre R., Cornavin P., Merrien D., Seghezzi J-C., Machado M., Diab G., Raffi F., Bonnet B., Allavena C., Grossi O., Reliquet V., Billaud E., Brunet C., Bouchez S., Morineau-Le Houssine P., Sauser F., Boutoille D., Besnier M., Hue H., Hall N., Brosseau D., Souala F., Michelet C., Tattevin P., Arvieux C., Revest M., Leroy H., Chapplain J-M., Dupont M., Fily F., Patra-Delo S., Lefeuvre C., Bernard L., Bastides F., Nau P., Verdon R., de la Blanchardiere A., Martin A., Feret P., Geffray L., Daniel C., Rohan J., Fialaire P., Chennebault JM., Rabier V., Abgueguen P., Rehaiem S., Luycx O., Niault M., Moreau P., Poinsignon Y., Goussef M., Mouton-Rioux V., Houlbert D., Alvarez-Huve S., Barbe F., Haret S., Perre P., Leantez-Nainville S., Esnault J-L., Guimard T., Suaud I., Girard J-J., Simonet V., Debab Y., Schmit J-L., Jacomet C., Weinberck P., Genet C., Pinet P., Ducroix S., Durox H., Denes É., Abraham B., Gourdon F., Antoniotti O., Molina J-M., Ferret S., Lascoux-Combe C., Lafaurie M., Colin de Verdiere N., Ponscarme D., De Castro N., Aslan A., Rozenbaum W., Pintado C., Clavel F., Taulera O., Gatey C., Munier A-L., Gazaigne S., Penot P., Conort G., Lerolle N., Leplatois A., Balausine S., Delgado J., Timsit J., Tabet M., Gerard L., Girard P-M., Picard O., Tredup J., Bollens D., Valin N., Campa P., Bottero J., Lefebvre B., Tourneur M., Fonquernie L., Wemmert C., Lagneau J-L., Yazdanpanah Y., Phung B., Pinto A., Vallois D., Cabras O., Louni F., Pialoux G., Lyavanc T., Berrebi V., Chas J., Lenagat S., Rami A., Diemer M., Parrinello M., Depond A., Salmon D., Guillevin L., Tahi T., Belarbi L., Loulergue P., Zak Dit Zbar O., Launay O., Silbermann B., Leport C., Alagna L., Pietri M-P., Simon A., Bonmarchand M., Amirat N., Pichon F., Kirstetter M., Katlama C., Valantin MA., Tubiana R., Caby F., Schneider L., Ktorza N., Calin R., Merlet A., Ben Abdallah S., Weiss L., Buisson M., Batisse D., Karmochine M., Pavie J., Minozzi C., Jayle D., Castel P., Derouineau J., Kousignan P., Eliazevitch M., Pierre I., Collias L., Viard J-P., Gilquin J., Sobel A., Slama L., Ghosn J., Hadacek B., Thu-Huyn N., Nait-Ighil L., Cros A., Maignan A., Duvivier C., Consigny PH., Lanternier F., Shoai-Tehrani M., Touam F., Jerbi S., Bodard L., Jung C., Goujard C., Quertainmont Y., Duracinsky M., Segeral O., Blanc A., Peretti D., Cheret A., Chantalat C., Dulucq MJ., Levy Y., Lelievre JD., Lascaux AS., Dumont C., Boue F., Chambrin V., Abgrall S., Kansau I., Raho-Moussa M., De Truchis P., Dinh A., Davido B., Marigot D., Berthe H., Devidas A., Chevojon P., Chabrol A., Agher N., Lemercier Y., Chaix F., Turpault I., Bouchaud O., Honore P., Rouveix E., Reimann E., Belan AG., Godin Collet C., Souak S., Mortier E., Bloch M., Simonpoli A-M., Manceron V., Cahitte I., Hiraux E., Lafon E., Cordonnier F., Zeng A-F., Zucman D., Majerholc C., Bornarel D., Uludag A., Gellen-Dautremer J., Lefort A., Bazin C., Daneluzzi V., Gerbe J., Jeantils V., Coupard M., Patey O., Bantsimba J., Delllion S., Paz PC., Cazenave B., Richier L., Garrait V., Delacroix I., Elharrar B., Vittecoq D., Bolliot C., Lepretre A., Genet P., Masse V., Perrone V., Boussard J-L., Chardon P., Froguel E., Simon P., Tassi S., Avettand Fenoel V., Barin F., Bourgeois C., Cardon F., Chaix M-L., Delfraissy JF., Essat A., Fischer H., Lecuroux C., Meyer L., Petrov-Sanchez V., Rouzioux C., Saez-Cirion A., Seng R., Kuldanek K., Mullaney S., Young C., Zucchetti A., Bevan M-A., McKernan S., Wandolo E., Richardson C., Youssef E., Green P., Faulkner S., Faville R., Herman S., Care C., Blackman H., Bellenger K., Fairbrother K., Phillips A., Babiker A., Delpech V., Fidler S., Clarke M., Fox J., Gilson R., Goldberg D., Hawkins D., Johnson A., Johnson M., McLean K., Nastouli E., Post F., Kennedy N., Pritchard J., Andrady U., Rajda N., Donnelly C., McKernan S., Drake S., Gilleran G., White D., Ross J., Harding J., Faville R., Sweeney J., Flegg P., Toomer S., Wilding H., Woodward R., Dean G., Richardson C., Perry N., Gompels M., Jennings L., Bansaal D., Browing M., Connolly L., Stanley B., Estreich S., Magdy A., O’Mahony C., Fraser P., Jebakumar SPR., David L., Mette R., Summerfield H., Evans M., White C., Robertson R., Lean C., Morris S., Winter A., Faulkner S., Goorney B., Howard L., Fairley I., Stemp C., Short L., Gomez M., Young F., Roberts M., Green S., Sivakumar K., Minton J., Siminoni A., Calderwood J., Greenhough D., DeSouza C., Muthern L., Orkin C., Murphy S., Truvedi M., McLean K., Hawkins D., Higgs C., Moyes A., Antonucci S., McCormack S., Lynn W., Bevan M., Fox J., Teague A., Anderson J., Mguni S., Post F., Campbell L., Mazhude C., Russell H., Gilson R., Carrick G., Ainsworth J., Waters A., Byrne P., Johnson M., Fidler S., Kuldanek K., Mullaney S., Lawlor V., Melville R., Sukthankar A., Thorpe S., Murphy C., Wilkins E., Ahmad S., Green P., Tayal S., Ong E., Meaden J., Riddell L., Loay D., Peacock K., Blackman H., Harindra V., Saeed AM., Allen S., Natarajan U., Williams O., Lacey H., Care C., Bowman C., Herman S., Devendra SV., Wither J., Bridgwood A., Singh G., Bushby S., Kellock D., Young S., Rooney G., Snart B., Currie J., Fitzgerald M., Arumainayyagam J., Chandramani S., Rajamanoharan S., Robinson T., Taylor B., Brewer C., Mayr C., Schmidt W., Speidel A., Strohbach F., Arastéh K., Cordes C., Stündel M., Claus J., Baumgarten A., Carganico A., Ingiliz P., Dupke S., Freiwald M., Rausch M., Moll A., Schleehauf D., Hintsche B., Klausen G., Jessen H., Jessen A., Köppe S., Kreckel P., Schranz D., Fischer K., Schulbin H., Speer M., Glaunsinger T., Wicke T., Bieniek B., Hillenbrand H., Schlote F., Lauenroth-Mai E., Schuler C., Schürmann D., Wesselmann H., Brockmeyer N., Gehring P., Schmalöer D., Hower M., Spornraft-Ragaller P., Häussinger D., Reuter S., Esser S., Markus R., Kreft B., Berzow D., Christl A., Meyer A., Plettenberg A., Stoehr A., Graefe K., Lorenzen T., Adam A., Schewe K., Weitner L., Fenske S., Hansen S., Stellbrink H-J., Wiemer D., Hertling S., Schmidt R., Arbter P., Claus B., Galle P., Jäger H., Jä̈gel-Guedes E., Postel N., Fröschl M., Spinner C., Bogner J., Salzberger B., Schölmerich J., Audebert F., Marquardt T., Schaffert A., Schnaitmann E., Trein A., Frietsch B., Müller M., Ulmer A., Detering-Hübner B., Kern P., Schubert F., Dehn G., Schreiber M., Güler C., Gunsenheimer-Bartmeyer B., Schmidt D., Meixenberger K., Bannert N.
We discovered a highly virulent variant of subtype-B HIV-1 in the Netherlands. One hundred nine individuals with this variant had a 0.54 to 0.74 log 10 increase (i.e., a ~3.5-fold to 5.5-fold increase) in viral load compared with, and exhibited CD4 cell decline twice as fast as, 6604 individuals with other subtype-B strains. Without treatment, advanced HIV—CD4 cell counts below 350 cells per cubic millimeter, with long-term clinical consequences—is expected to be reached, on average, 9 months after diagnosis for individuals in their thirties with this variant. Age, sex, suspected mode of transmission, and place of birth for the aforementioned 109 individuals were typical for HIV-positive people in the Netherlands, which suggests that the increased virulence is attributable to the viral strain. Genetic sequence analysis suggests that this variant arose in the 1990s from de novo mutation, not recombination, with increased transmissibility and an unfamiliar molecular mechanism of virulence.